SARP — code de sortie HTML pour R : Emmanuel CURIS, août 2010 — mai 2015.

Préparation et Relecture de l'article

Date de création : mer. 03 mai 2023 à 10:46:18.
Auteur  : Emmanuel CURIS .

Version de R utilisée : R version 4.0.2 (2020-06-22).
Génération de nombres aléatoires :
— générateur = Mersenne-Twister ;
— méthode pour obtenir une distribution gaussienne = Inversion ;
— racine utilisée : 1974872004.

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Chargement et Préparation des données

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Chargement des données

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Chargement des fichiers

Les variables sont en colonnes, les individus en lignes.
Au total, 4 fichiers doivent être chargés.
Les fichiers sont lus dans le dossier Données.

Fichier Nom Résumé
dosages.2021-08-16_EC.csv Dosages Valeurs de 11 variables [colonnes] lues pour 4620 individus [lignes].
patients.2023-04-14_EC.csv Patients Valeurs de 33 variables [colonnes] lues pour 165 individus [lignes].
dosages_PF4.2022-04-07b_EC.csv PF4 Valeurs de 5 variables [colonnes] lues pour 180 individus [lignes].
tubes.2022-11-04_EC.csv Tubes Valeurs de 11 variables [colonnes] lues pour 19 individus [lignes].
Certaines variables ne prennent qu'une seule valeur et sont donc inutiles : on les élimine — variable concernée : Vide (valeur : Total).
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Préparation des données

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Préparation complémentaire des données

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Sélection des données

Les analyses ne sont faites que sur les dosages réalisés en utilisant l'étalonnage « constructeur ».
Base des dosages : 2310 dosages avec l'étalon international exclus de l'analyse.
Base fusionnée : 2310 dosages avec l'étalon international exclus de l'analyse.

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Résumé de l'article

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Contexte (Background)

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Objectifs (Objectives)

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Plan expérimental (Patients/Methods)

Nombre de centres : 8.
Nombre de groupes de patients : 4.
Groupes de patients : Post-CEC, Réa. chir., Réa. med. + ECMO, Autre.

Groupe 1
Post-CEC		 Groupe 2
Réa. chir.		 Groupe 3
Réa. med. + ECMO		 Groupe 4
Autre
Effectif 39 35 53 38
Nombre de méthodes : 7.
Nombre de réactifs sans dextran : 2 [STA Liquid anti-Xa, Berichrom heparin] (en comptant le berichrom reconstitué sans dextran).

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Résultats (Results)

Nombre de patients : 165.
Nombre de mesures obtenu — étalon constructeur : 2273.
Activité anti-Xa moyenne dans le groupe 1 : 0,32 UI/mL avec dextran vs 0,05 UI/mL sans dextran.
Interaction dextran/groupe : p < 0,0001.
Interaction tube/groupe : p = 0,0302.

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Conclusion

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Article proprement dit

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Introduction

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Premier paragraphe

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Deuxième paragraphe

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Troisième paragraphe

Nombre de groupes de patients : 4.
Nombre de méthodes : 7.

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Patients et Méthodes

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Patients

Nombre de centres : 8.
Centres : Bordeaux, Dijon, Lariboisière, Lille, Nancy, Necker, Rennes, Versailles.
Date du premier prélèvement : 2001-01-13.
Date du dernier prélèvement : 2021-11-05.

Les patients doivent avoir plus de 18 ans. C'est bien le cas (âge minimal : 24 ans).

Nombre de groupes de patients : 4.
Groupes de patients : Post-CEC, Réa. chir., Réa. med. + ECMO, Autre.

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Prélèvements (Blood collection, processing and storage)

Molarité des tubes citratés : 0,109 M.
Références des tubes BD : 363048 (Citrate), 364305 (Citrate), 367599 (CTAD).
Références des tubes Greiner : 454327 (Citrate), 474304 (CTAD), 454064 (CTAD).

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Mesure de l'activité anti-Xa (Anti-Xa assessment)

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Premier paragraphe

Nombre de méthodes : 7.
Méthodes :
— réactif STA Liquid anti-Xa avec automate STAR [sans dextran] ;
— réactif Biophen heparin LRT avec automate ACL [avec dextran] ;
— réactif Biophen heparin LRT avec automate STAR [avec dextran] ;
— réactif HemosIL liquid anti-Xa avec automate ACL [avec dextran] ;
— réactif Berichrom heparin avec automate CS [avec dextran] ;
— réactif Berichrom heparin avec automate CS [sans dextran] ;
— réactif Innovance heparin avec automate CS [avec dextran].

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Deuxième paragraphe — étalonnage par le kit international

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Troisième paragraphe

Nombre de réactifs avec dextran : 4 [Biophen heparin LRT, HemosIL liquid anti-Xa, Berichrom heparin, Innovance heparin]
Nombre de réactifs sans dextran : 2 [STA Liquid anti-Xa, Berichrom heparin] (en comptant le berichrom reconstitué sans dextran).

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Quatrième paragraphe

Nombre de centres de dosage : 5.
Centres ayant réalisé les dosages : Bordeaux, Lariboisière, Lille, Necker, Rennes, Nancy.
Limite de quantification : 0,1 UI/mL (quelle que soit la méthode de dosage).
Les valeurs en dessous de la limite de quantification on été prises égales à la moitié de cette limite — soit 0,05 UI/mL.

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Analyse statistique

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Premier paragraphe

Version de R : 4.0.2.
Version de lme4 : 1.1.32.
Risque de 1re espèce (α) : 0,05 (soit 5 %).
Confiance des intervalles : 0,95 (soit 95 %).

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Résultats

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Patients

Nombre de patients : 165 — dont 114 hommes et 51 femmes.
Répartition des patients par groupe (les âges sont exprimées en moyenne [min ; max]) :

Groupe 1
Post-CEC		 Groupe 2
Réa. chir.		 Groupe 3
Réa. med. + ECMO		 Groupe 4
Autre
Effectif 39 35 53 38
Âge (années) m = 66,67 ; me = 70 [24 ; 83] m = 64,03 ; me = 66 [39 ; 81] m = 65,13 ; me = 68 [27 ; 85] m = 68,61 ; me = 69,5 [36 ; 98]
Pourcentage de femmes 35,9 % 28,57 % 33,96 % 23,68 %
Nombre de patients avec ECMO 0 1 5 0
Valeur pour l'ECMO indisponible pour 123 patients.

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Mesure des activités anti-Xa (Anti-Xa values measured with the different combinations in the four patient groups)

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Premier paragraphe

Ce paragraphe renvoie à la figure 01, au tableau 01 et au tableau 02.

21 échantillons centrifugés plus de 2 h après le prélèvement (soit 12,73 %).

Tubes centrifugés dans la 1re heure : 120 (soit 72,73 %).
Tubes centrifugés dans les 2 premières heures : 144 (soit 87,27 %).
Délais : de 0 min à 9,3 h ; délai médian : 0,55 h — quartiles : [0,2833 ; 1,2].

Nombre de mesures attendu : 165×7×2×2 = 4620 — soit 2310 par méthode d'étalonnage.
Nombre de mesures obtenu (non manquantes) : 4546 — soit 74 dosages manquants.
Nombre de mesures obtenu — étalon constructeur : 2273 — soit 37 dosages manquants.
Nombre de mesures obtenu — étalon international : 2273 — soit 37 dosages manquants.
Lien entre méthode et mesure absente : p = 0,3111 (test exact de Fisher).

Méthode
Berichrom heparin:Non:CS Berichrom heparin:Oui:CS Biophen heparin LRT:Oui:ACL Biophen heparin LRT:Oui:STAR HemosIL liquid anti-Xa:Oui:ACL Innovance heparin:Oui:CS STA Liquid anti-Xa:Non:STAR
Dosage Manquant 5 5 3 8 9 5 2 37
Présent 325 325 327 322 321 325 328 2273
330 330 330 330 330 330 330 2310

Lien entre type de tube et mesure absente : p = 0,0072 (test exact de Fisher).
Méthode
Citrate CTAD
Dosage Manquant 10 27 37
Présent 1145 1128 2273
1155 1155 2310

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Deuxième paragraphe

Ce paragraphe renvoie à la figure 01, à la figure 02 et au tableau 02.

Pourcentage de valeurs inférieures (ou égales) à la limite de quantification (tous groupes et tubes confondus) : 41,5 % en l'absence de dextran — 15,31 % en présence de dextran.
Pourcentage de valeurs inférieures (ou égales) à la limite de quantification (tube citraté, tous groupes confondus) : 46,81 % en l'absence de dextran — 17,89 % en présence de dextran.
Pourcentage de valeurs inférieures (ou égales) à la limite de quantification dans le groupe 1 (tube citraté) : 76,92 % en l'absence de dextran — 6,154 % en présence de dextran.

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Modélisation (Modeling the effect of dextran sulfate and CTAD on anti-Xa levels (IU/mL))

Ce paragraphe renvoie au tableau 03.

Les comparaisons entre modèles pour simplifier le modèle complet sont faites par modèles emboîtés (loi asymptotique du khi-deux) toujours par rapport au modèle complet.
Sont aussi donnés l'AIC (qui doit être minimal), le BIC (qui doit être minimal), et la ln-vraisemblance de chaque modèle (qui doit être maximale).
Modèle complet : AIC = 2663 — BIC = 2766 — ln V = −1313.
Interaction triple : AIC = 2661 — BIC = 2747 — ln V = −1316 — p = 0,2229.
Interaction dextran-groupe : AIC = 3221 — BIC = 3290 — ln V = −1598 — p < 0,0001.
Interaction tube-groupe : AIC = 2664 — BIC = 2733 — ln V = −1320 — p = 0,0380.
Interaction tube-dextran : AIC = 2663 — BIC = 2743 — ln V = −1317 — p = 0,0904.
Interaction tube-groupe (après avoir ôté l'interaction tube-dextran) : AIC = 2666 — BIC = 2729 — ln V = −1322 — p = 0,0176.
Interaction dextran-groupe (après avoir ôté l'interaction tube-dextran) : AIC = 3221 — BIC = 3284 — ln V = −1600 — p < 0,0001.
Effet du tube : AIC = 2739 — BIC = 2796 — ln V = −1360 — p < 0,0001.
Conclusion : on garde le modèle avec les effets du type de tube (citrate ou CTAD), du dextran (présence ou absence) et du groupe (quatre groupes) et la seule interaction entre le groupe et la présence de dextran.

Groupe de référence : Post-CEC.
Tube de référence : Citrate.
Référence pour le dextran : Non.
Le modèle s'écrit
ln Ai, j, t = µ0 + Uj + δDextran 1Dextran(i) + δCTAD 1CTAD(t) + Σk = 23 δGroupe k 1Groupe k(j) + Σk = 23 δDextran:k 1Dextran(t) 1Groupe k(j) + Σk = 23 δCTAD:k 1CTAD(t) 1Groupe k(j) + εi, j
où Ai, j, t est l'activité anti-Xa mesurée par la technique i chez le patient j avec un tube de type t.

Effet du dextran (tube citraté)
Dans le groupe 1 : +296 % (IC à 95 % : [257,7 ; 338,4]).
Dans le groupe 4 : +30,23 % (IC à 95 % : [17,4 ; 44,46]).
Effet du CTAD
Dans le groupe 1 : +7,87 % (IC à 95 % : [−1,598 ; 18,25]).
Dans le groupe 2 : +23,92 % (IC à 95 % : [12,47 ; 36,54]).

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Discussion

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Premier paragraphe

Nombre de méthodes de dosage : 7.
Nombre de patients : 165.
Effet du CTAD : +7,87 %.

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Deuxième paragraphe

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Troisième paragraphe

Pourcentage de valeurs inférieures (ou égales) à la limite de quantification dans le groupe 1 (tube citraté) : 76,92 % en l'absence de dextran — 6,154 % en présence de dextran.

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Quatrième paragraphe

Effet du dextran dans le groupe 3 : +53,31 %.
Médiane de l'activité (tube citraté) : 0,22 UI/mL sans dextran et 0,305 UI/mL avec dextran.

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Cinquième paragraphe

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Sixième paragraphe

Effet du CTAD : +7,87 % (quel que soit le tube, CTAD ou citraté).

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Septième paragraphe

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Huitième paragraphe

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Conclusion

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Tableaux pour l'article

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Tableau 1 — Résultats obtenus

HemosIL liquid anti-Xa.Oui.ACL Biophen heparin LRT.Oui.ACL Biophen heparin LRT.Oui.STAR Innovance heparin.Oui.CS Berichrom heparin.Oui.CS Berichrom heparin.Non.CS STA Liquid anti-Xa.Non.STAR
Dextran Oui Oui Oui Oui Oui Non Non
Automate ACL ACL STAR CS CS CS STAR
Dosages réalisés avec l'étalon associé au kit
Citrate n 162 164 162 164 164 164 165
Médiane (UI/mL) 0,315 0,3 0,275 0,23 0,25 0,15 0,05
min – max (UI/mL) 0,05 – 1,76 0,05 – 2,6 0,09 – 1,89 0,05 – 1,5 0,05 – 2,16 0,05 – 1,84 0,03 – 1,75
< 0,1 UI/mL (n) 27 (16,67 %) 23 (14,02 %) 33 (20,37 %) 32 (19,51 %) 31 (18,9 %) 67 (40,85 %) 87 (52,73 %)
CTAD n 159 163 160 161 161 161 163
Médiane (UI/mL) 0,36 0,35 0,34 0,29 0,27 0,2 0,13
min – max (UI/mL) 0,02 – 1,71 0,05 – 2,68 0,09 – 1,81 0,05 – 1,45 0,05 – 2,02 0,05 – 1,8 0,05 – 1,84
< 0,1 UI/mL (n) 18 (11,32 %) 14 (8,589 %) 22 (13,75 %) 21 (13,04 %) 27 (16,77 %) 46 (28,57 %) 71 (43,56 %)
Dosages réalisés avec l'étalon international
Citrate n 162 164 162 164 164 164 165
Médiane (UI/mL) 0,24 0,28 0,237864231791342 0,245 0,25 0,08 0,104103528092195
min – max (UI/mL) 0,05 – 1,59 0,05 – 2,64 0 – 1,64399208227234 0,05 – 1,66 0,05 – 2,1 0,05 – 1,5 0,0160664078690125 – 1,83592655466699
< 0,1 UI/mL (n) 40 (24,69 %) 32 (19,51 %) 40 (24,69 %) 30 (18,29 %) 30 (18,29 %) 87 (53,05 %) 82 (49,7 %)
CTAD n 159 163 160 161 161 161 163
Médiane (UI/mL) 0,29 0,33 0,295591464071733 0,32 0,27 0,12 0,141596533730918
min – max (UI/mL) 0,02 – 1,71 0,05 – 2,68 0,09 – 1,81 0,05 – 1,45 0,05 – 2,02 0,05 – 1,8 0,05 – 1,84
< 0,1 UI/mL (n) 30 (18,87 %) 20 (12,27 %) 23 (14,38 %) 21 (13,04 %) 27 (16,77 %) 71 (44,1 %) 66 (40,49 %)
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Tableau 2 — Caractéristiques des patients

Post-CEC Réa. chir. Réa. med. + ECMO Autre Tout
Statistiques descriptives
Âge n = 39
70
[24 ; 83]		 n = 35
66
[39 ; 81]		 n = 53
68
[27 ; 85]		 n = 38
69,5
[36 ; 98]		 n = 165
69
[24 ; 98]
Sexe
FM Total
14 25 39
FM Total
10 25 35
FM Total
18 35 53
FM Total
9 29 38
FM Total
51 114 165
Dosages réalisés avec l'étalon associé au kit
Sans dextran, citrate n = 78 dont 60 < LOQ (soit 76,92 %)
0,05
[0,05 ; 1,62]		 n = 70 dont 45 < LOQ (soit 64,29 %)
0,05
[0,05 ; 0,35]		 n = 105 dont 29 < LOQ (soit 27,62 %)
0,22
[0,05 ; 1,84]		 n = 76 dont 20 < LOQ (soit 26,32 %)
0,47
[0,05 ; 1,75]		 n = 329
0,12
[0,05 ; 1,84]
Sans dextran, CTAD n = 78 dont 57 < LOQ (soit 73,08 %)
0,05
[0,05 ; 1,46]		 n = 70 dont 30 < LOQ (soit 42,86 %)
0,12
[0,05 ; 0,42]		 n = 102 dont 17 < LOQ (soit 16,67 %)
0,26
[0,05 ; 1,8]		 n = 74 dont 13 < LOQ (soit 17,57 %)
0,555
[0,05 ; 1,84]		 n = 324
0,17
[0,05 ; 1,84]
Avec dextran, citrate n = 195 dont 12 < LOQ (soit 6,154 %)
0,32
[0,05 ; 1,6]		 n = 175 dont 88 < LOQ (soit 50,29 %)
0,05
[0,05 ; 0,71]		 n = 256 dont 19 < LOQ (soit 7,422 %)
0,305
[0,05 ; 2,6]		 n = 190 dont 27 < LOQ (soit 14,21 %)
0,55
[0,05 ; 2,16]		 n = 816
0,28
[0,05 ; 2,6]
Avec dextran, CTAD n = 195 dont 7 < LOQ (soit 3,59 %)
0,34
[0,05 ; 1,52]		 n = 175 dont 58 < LOQ (soit 33,14 %)
0,13
[0,05 ; 0,67]		 n = 249 dont 13 < LOQ (soit 5,221 %)
0,34
[0,05 ; 2,68]		 n = 185 dont 24 < LOQ (soit 12,97 %)
0,59
[0,05 ; 2,12]		 n = 804
0,32
[0,05 ; 2,68]
Dosages réalisés avec l'étalon international
Sans dextran, citrate n = 78 dont 60 < LOQ (soit 76,92 %)
0,05
[0,05 ; 1,697]		 n = 70 dont 55 < LOQ (soit 78,57 %)
0,05
[0,05 ; 0,3354]		 n = 105 dont 33 < LOQ (soit 31,43 %)
0,18
[0,05 ; 1,825]		 n = 76 dont 21 < LOQ (soit 27,63 %)
0,3837
[0,05 ; 1,836]		 n = 329
0,05
[0,05 ; 1,836]
Sans dextran, CTAD n = 78 dont 57 < LOQ (soit 73,08 %)
0,05
[0,05 ; 1,532]		 n = 70 dont 44 < LOQ (soit 62,86 %)
0,05
[0,05 ; 0,3818]		 n = 102 dont 22 < LOQ (soit 21,57 %)
0,2146
[0,05 ; 1,66]		 n = 74 dont 14 < LOQ (soit 18,92 %)
0,5
[0,05 ; 1,927]		 n = 324
0,1387
[0,05 ; 1,927]
Avec dextran, citrate n = 195 dont 21 < LOQ (soit 10,77 %)
0,3
[0,05 ; 1,52]		 n = 175 dont 98 < LOQ (soit 56 %)
0,05
[0,05 ; 0,72]		 n = 256 dont 25 < LOQ (soit 9,766 %)
0,29
[0,05 ; 2,64]		 n = 190 dont 28 < LOQ (soit 14,74 %)
0,5227
[0,05 ; 2,12]		 n = 816
0,25
[0,05 ; 2,64]
Avec dextran, CTAD n = 195 dont 8 < LOQ (soit 4,103 %)
0,32
[0,05 ; 1,48]		 n = 175 dont 72 < LOQ (soit 41,14 %)
0,12
[0,05 ; 0,68]		 n = 249 dont 17 < LOQ (soit 6,827 %)
0,317
[0,05 ; 2,68]		 n = 185 dont 24 < LOQ (soit 12,97 %)
0,56
[0,05 ; 2,12]		 n = 804
0,3
[0,05 ; 2,68]
▼

Tableau 3 — Résultats du modèle

Le modèle complet, ajusté au logarithme des activités anti-Xa, intègre les prédicteurs suivants :
— le groupe de patients ;
— le type de tube (citrate ou CTAD, référence : citrate) ;
— la présence de Dextran (référence : absence de Dextran) ;
— l'interaction entre le type de tube et la présence de Dextran ;
— l'interaction entre le groupe et la présence de Dextran ;
— l'interaction entre le groupe et le type de tube ;
— l'interaction triple entre le groupe, le type de tube et la présence de Dextran ;
— un effet aléatoire « Patient » (supposé gaussien et indépendant de l'erreur résiduel).

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Dosages réalisés avec l'étalon associé au kit

Ce modèle permet de déduire qu'il n'y a pas d'interaction triple (p = 0,2229), et pas d'interaction entre le type de tube et la présence de dextran (p = 0,0904 ; en revanche, il existe une interaction entre le groupe et le type de tube (p = 0,0380) test asymptotique global des modèles emboîtés). — globalement, p = 0,0904 ; Les résultats sont donc données à partir du modèle simplifié omettant ces termes.

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Coefficients du modèle

L'ordonnée à l'origine correspond à la valeur dans le groupe de référence (Post-CEC) pour un tube citrate sans dextran.

Terme Échelle ln Échelle originale
δ I. C. à 95 % eδ I. C. à 95 %
Ordonnée à l'origine µ0 = −2,561 [−2,787 ; −2,335] 0,07721 [0,06158 ; 0,09682]
Variation due au groupe (tube citrate, sans dextran)
Groupe Réa. chir. 0,0756 [−0,2534 ; 0,4046] 7,853 % [−22,38 ; 49,87]
Groupe Réa. med. + ECMO 0,884 [0,5858 ; 1,182] 142,1 % [79,64 ; 226,1]
Groupe Autre 1,288 [0,9662 ; 1,61] 262,7 % [162,8 ; 400,5]
Effet du tube (groupe 1, avec et sans dextran)
CTAD 0,07576 [0,01269 ; 0,1388] 1,079 [1,013 ; 1,149]
Effet du dextran (groupe 1, quel que soit le tube)
Dextran 1,376 [1,306 ; 1,446] 3,96 [3,693 ; 4,246]
Effet additionnel du dextran dans les autres groupes (quel que soit le tube)
Dextran, groupe Réa. chir. −1,056 [−1,157 ; −0,954] −65,2 % [−68,56 ; −61,48]
Dextran, groupe Réa. med. + ECMO −0,9489 [−1,042 ; −0,8563] −61,28 % [−64,71 ; −57,53]
Dextran, groupe Autre −1,112 [−1,212 ; −1,012] −67,11 % [−70,23 ; −63,66]
Effet additionnel du CTAD dans les autres groupes (avec ou sans dextran)
CTAD, groupe Réa. chir. 0,1387 [0,04699 ; 0,2304] 14,88 % [4,811 ; 25,91]
CTAD, groupe Réa. med. + ECMO 0,0539 [−0,03013 ; 0,1379] 5,538 % [−2,968 ; 14,79]
CTAD, groupe Autre 0,06964 [−0,02064 ; 0,1599] 7,212 % [−2,043 ; 17,34]

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Présentation des résultats du modèle

L'effet du dextran étant différent d'un groupe à l'autre (interaction significative, p < 0,0001), les résultats du modèle sont présentés pour chaque groupe séparément pour clarifier l'interprétation.
Les intervalles de confiance sont ici donnés après correction de multiplicité (approximation d'une loi gaussienne multidimensionnelle).
Toutes les valeurs sont données dans l'échelle des activités anti-Xa (UI/mL).

Facteur Post-CEC Réa. chir. Réa. med. + ECMO Autre
Basal 0,07721 (IC : [0,05562 ; 0,1072]) 0,08328 (IC : [0,0589 ; 0,1177]) 0,1869 (IC : [0,141 ; 0,2477]) 0,28 (IC : [0,2008 ; 0,3905])
CTAD +7,87 % (IC : [−1,598 ; 18,25]) +23,92 % (IC : [12,47 ; 36,54]) +13,84 % (IC : [4,998 ; 23,44]) +15,65 % (IC : [5,265 ; 27,06])
Dextran +296 % (IC : [257,7 ; 338,4]) +37,8 % (IC : [23,78 ; 53,42]) +53,31 % (IC : [40,3 ; 67,51]) +30,23 % (IC : [17,4 ; 44,46])

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Dosages réalisés avec l'étalon international

Ce modèle permet de déduire qu'il n'y a pas d'interaction triple (p = 0,3830), pas d'interaction entre le type de tube et la présence de dextran (p = 0,2881), et pas d'interaction entre le groupe et le type de tube (p = 0,1443). En revanche, il existe une interaction entre le groupe et la présence de dextran (p < 0,0001), — globalement, p = 0,1190 ; tous les tests sont des tests asymptotiques des modèles emboîtés. Les résultats sont donc données à partir du modèle simplifié omettant ces termes.

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Coefficients du modèle — modèle final

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Coefficients du modèle — modèle similaire à celui du kit constructeur

L'ordonnée à l'origine correspond à la valeur dans le groupe de référence (Post-CEC) pour un tube citrate sans dextran.

Terme Échelle ln Échelle originale
δ I. C. à 95 % eδ I. C. à 95 %
Ordonnée à l'origine µ0 = −2,584 [−2,818 ; −2,349] 0,07549 [0,05972 ; 0,09542]
Variation due au groupe (tube citrate, sans dextran)
Groupe Réa. chir. −0,03462 [−0,3753 ; 0,306] −3,403 % [−31,29 ; 35,8]
Groupe Réa. med. + ECMO 0,8012 [0,4925 ; 1,11] 122,8 % [63,63 ; 203,4]
Groupe Autre 1,226 [0,8922 ; 1,559] 240,7 % [144,1 ; 375,6]
Effet du tube (groupe 1, avec et sans dextran)
CTAD 0,1077 [0,04289 ; 0,1725] 1,114 [1,044 ; 1,188]
Effet du dextran (groupe 1, quel que soit le tube)
Dextran 1,304 [1,232 ; 1,376] 3,684 [3,429 ; 3,958]
Effet additionnel du dextran dans les autres groupes (quel que soit le tube)
Dextran, groupe Réa. chir. −1,037 [−1,141 ; −0,9328] −64,55 % [−68,07 ; −60,66]
Dextran, groupe Réa. med. + ECMO −0,8513 [−0,9465 ; −0,7561] −57,32 % [−61,19 ; −53,05]
Dextran, groupe Autre −1,037 [−1,139 ; −0,9345] −64,55 % [−68 ; −60,72]

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Présentation des résultats du modèle

L'effet du dextran étant différent d'un groupe à l'autre (interaction significative, p < 0,0001), les résultats du modèle sont présentés pour chaque groupe séparément pour clarifier l'interprétation.
Les intervalles de confiance sont ici donnés après correction de multiplicité (approximation d'une loi gaussienne multidimensionnelle).
Toutes les valeurs sont données dans l'échelle originelle.

Facteur Post-CEC Réa. chir. Réa. med. + ECMO Autre
Basal 0,07549 (IC : [0,05375 ; 0,106]) 0,07292 (IC : [0,05095 ; 0,1044]) 0,1682 (IC : [0,1257 ; 0,2252]) 0,2572 (IC : [0,1823 ; 0,3629])
CTAD +11,37 % (IC : [1,338 ; 22,4]) +25,01 % (IC : [13,15 ; 38,11]) +13,91 % (IC : [4,805 ; 23,81]) +16 % (IC : [5,307 ; 27,77])
Dextran +268,4 % (IC : [231,8 ; 308,9]) +30,57 % (IC : [16,93 ; 45,8]) +57,23 % (IC : [43,54 ; 72,24]) +30,6 % (IC : [17,4 ; 45,29])

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Figures pour l'article

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Figure 1 — Vue d'ensemble des résultats

La figure est faite uniquement pour l'étalon du kit. L'équivalent avec l'étalon international n'est pas représenté.
Code couleur & symbole : en fonction du groupe — disque rouge : groupe 1 ; triangle vert : groupe 2 ; cercle bleu : groupe 3 ; astérisque orange : groupe 4.
Les boîtes à moustaches et blocs de valeurs indétectables sont en noir pour le tube citraté et en jaune pour le tube CTAD.
La limite de détection est le trait horizontal orange.
Nombre de valeurs indétectables (étalon constructeur) : 519.
Figures/fig_1.png

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Figure 2 — Résultats pour le Berichrom

La figure est faite uniquement pour le tube citraté, étalon du kit. L'équivalent pour le tube CTAD est dans les figures additionnelles. Les équivalents avec l'étalon international ne sont pas représentés.
Le code couleur des groupes est le même que pour la figure 1.
1 dosage manquant aussi bien avec que sans dextran.
Figures/fig_2.png

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Figure 3 — Comparaison des méthodes avec et sans dextran

La figure est faite uniquement pour le tube citraté, étalon du kit. L'équivalent pour le tube CTAD est dans les figures additionnelles. Les équivalents avec l'étalon international ne sont pas représentés.
Le code couleur des groupes est le même que pour la figure 1.
Figures/fig_3.png

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Informations additionnelles

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Figures additionnelles

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Figure S-1 — Comparaisons deux à deux des méthodes (tube citraté)
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Figure S-2 — Comparaisons des méthodes avec et sans dextran (tube CTAD)
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Figure S-3 — Comparaisons deux à deux des méthodes (tube CTAD)
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Figures inutilisées

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Comparaisons entre l'étalon du kit et l'étalon international

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Ensemble des résultats...

Étalon du kit Étalon international
Figures/fig_7.png Figures/fig_8.png
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Berichrom avec ou sans dextran, par groupe

Tube Citrate Tube CTAD
Dosages réalisés avec l'étalon associé au kit
1 dosage manquant aussi bien avec que sans dextran.
Figures/fig_9.png 		4 dosages manquants aussi bien avec que sans dextran.
Figures/fig_10.png
Dosages réalisés avec l'étalon international
1 dosage manquant aussi bien avec que sans dextran.
Figures/fig_11.png 		4 dosages manquants aussi bien avec que sans dextran.
Figures/fig_12.png
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Comparaison des méthodes avec dextran aux méthodes sans dextran

Tube Citrate Tube CTAD
Figures/fig_13.png Figures/fig_14.png
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Comparaison des méthodes avec dextran entre elles et des méthodes sans dextran entre elles

Tube Citrate Tube CTAD
Figures/fig_15.png Figures/fig_16.png
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Comparaisons des tubes CTAD et citrates pour chaque méthode

Étalon du kit Étalon international
Figures/fig_17.png Figures/fig_18.png
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Compléments pour répondre aux demandes des rapporteurs

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Demandes du rapporteur 3

Comparaison (graphique) des valeurs avec et sans dextran pour voir un éventuel effet dextran variant avec l'activité anti-Xa.

Tube citraté Tube CTAD
Résultat des étalonnages constructeurs
Figures/fig_19.png Figures/fig_20.png
Résultat de l'étalonnage international
Figures/fig_21.png Figures/fig_22.png
Comparaison des étalonnages
Figures/fig_23.png Figures/fig_24.png

Pour le Berichrom, on compare les changements de classe thérapeutique suivant que l'on dose avec un réactif avec ou sans dextran. On se limite au cas des tubes Citrate et de l'étalon du kit.
Groupe 1 (Post-CEC) : 26 patients passent de < 0,1 à > 0,1 (valeur allant de 0,11 à 0,84 , médiane : 0,25) soit 66,67 % des patients du groupe.
Groupe 4 (Autre) : 2 patients passent de < 0,3 (valeur allant de 0,24 à 0,26, médiane : 0,25) à > 0,3 (valeur allant de 0,35 à 0,46, médiane : 0,405) soit 5,128 % des patients du groupe.
Groupe 4 (Autre) : 6 patients passent de < 0,7 (valeur allant de 0,48 à 0,67, médiane : 0,56) à > 0,7 (valeur allant de 0,72 à 0,78, médiane : 0,735) soit 15,38 % des patients du groupe.
Figures/fig_25.png

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Demandes du rapporteur 4

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Comparaison des tubes citrate et CTAD

Pour chacune des méthodes, on compare les résultats du tube citraté (en abscisse) et du tube CTAD (en ordonnée). La droite bleue est la droite de Passing-Bablok, dont l'équation est donnée en bas, à droite. Les codes pour les points sont ceux des figures précédentes.

Étalon du kit Étalon international
En considérant tous les points
Figures/fig_26.png Figures/fig_27.png
En ne considérant que les points dosables par les deux méthodes
Figures/fig_28.png Figures/fig_29.png

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Résultats du modèle en ôtant le premier groupe

On recommence l'analyse sans prendre en compte les résultats obtenus dans le premier groupe (Post-CEC).
Modèle complet : AIC = 1935 — BIC = 2011 — ln V = −953,4.
Interaction triple : AIC = 1933 — BIC = 1998 — ln V = −954,3 — p = 0,3888.
Interaction tube-dextran : AIC = 1937 — BIC = 1997 — ln V = −957,5 — p = 0,0403.
Interaction tube-groupe : AIC = 1933 — BIC = 1987 — ln V = −956,4 — p = 0,1924.
Interaction dextran-groupe : AIC = 1942 — BIC = 1996 — ln V = −960,9 — p = 0,0047.
Effet du tube : AIC = 1933 — BIC = 1987 — ln V = −956,4 — p = 0,1924.
Conclusion : on garde le modèle avec les effets du type de tube (citrate ou CTAD), du dextran (présence ou absence) et du groupe (quatre groupes) mais aussi l'interaction entre le groupe et la présence de dextran et l'interaction entre le type de tube et la présence de dextran.

Contact pour plus d'infos ou de l'aide sur SARP :
Emmanuel CURIS
Dernière modification : jeudi 13 février 2017, 13 h 54